کتاب اکولوژی میکروبی: اکوسیستمهای غذایی اثر دکتر فخری شهیدی که توسط توسط نشر دانشگاه فردوسی مشهد و با همکاری پنج تن از استادان و پژوهشگران به رشتۀ تحریر درآمده است و میتواند بهعنوان یک درسنامه برای دانشجویان رشتههای علوم و صنایع غذایی، میکروبیولوژی، بهداشت و ایمنی و موادغذایی، خاکشناسی، بیماریهای گیاهی، علوم دامی، باغبانی، منابع طبیعی و محیط زیست مورداستفاده قرار گیرد. مخاطبان دیگر این کتاب، جامعۀ علمی کشاورزی در تمام سطوح هستند.
این کتاب مشتمل بر مفاهیم اصلی در مطالعۀ اکولوژی و سیر تکامل میکروارگانیسمها، چرخش مواد در اکوسیستم، گونه و گونهزایی، اکولوژی فرد و مطالعۀ میکروارگانیسمهای منفرد اکولوژی تولیدمثل در میکروارگانیسمها، اکولوژی جوامع، اکولوژی محیطهای آبی، خاک و سخت، تداخل میکروارگانیسمها با سایر اجزای محیط، رشد و تغذیه در میکروارگانیسمها، نقش میکروارگانیسمها در تولید موادغذایی و آنزیمها، اکولوژی میکروبی فاضلاب و بیماریهاست.
